意识到无法阻遏上杉军攻势后，黑川与四郎、芥川七郎兵卫等人见势不妙，就仓皇率三百余武士、足轻、忍者、农兵所组成的军势狼狈逃往石部城，准备向主君六角承祯告知菩提寺城、青木城、谷城三城陷落的消息。
起初，六角承祯、六角义治父子并不相信上杉军会大举南下发起对甲贺郡的侵攻。他们认为上杉清定还在观音寺城之中欢庆喜得一子，短时间内是不会挥师南下的。
早在上杉军樱田景亲部从川守城出阵后，六角承祯、六角义治父子二人就从百地三太夫处获知了上杉军大举来袭的消息。
还不到半天的功夫，位于石部城以北的菩提寺城、青木城、谷城三座支城几乎在同一时刻陷落，并伴随接连不断的轰鸣声响起。
这时的六角承祯、六角义治父子才后知后觉的意识到自己是被上杉家迷惑了。
可上杉军这边并没有给六角家任何做出应对的机会。
作为樱田景亲部先手役的藤堂虎高，率先率本部骑马武士五十余人强渡野洲川后，兵锋直指石部城。
黑川势、芥川势大都是步卒，战马屈指可数，很快就被藤堂部追上。
黑川与四郎、芥川七郎兵卫等人见自己无法摆脱上杉军的追兵后，就打算效仿百地三太夫在长光寺城之战中那样，设伏狙杀上杉军的有名武士，以迫使上杉军暂缓攻势。
但是，藤堂虎高可与先前被百地三太夫讨取的府中长尾家谱代家臣本庄玖介不同，他早在十六岁时就离开了近江前往甲斐出仕武田家，并以过人的武勇、才华受到武田信虎的重视，得以拜领武田信虎的偏讳‘虎’字。
而且，藤堂虎高对于甲贺众、伊贺众的战法也是颇为熟悉。先不说他本就出身于近江犬上郡，在离开东国后，他还先后出仕过京极家、浅井家，曾多次与六角军展开交锋。
在发现前方敌军的武士、足轻、农兵反身对己方军势发起冲击，且二十余名身着黑衣的忍者‘逃入’一旁的密林之中后，藤堂高虎当即判断出这是六角军忍者意图依托密林来对己方军势造成大量杀伤之计，而那些武士、足轻、农兵只不过是引诱自己的棋子罢了。
于是，藤堂虎高直接率麾下的五十余名骑马武士直扑阻挡自己的六角军。
毕竟从谷城逃离的六角军已经成惊弓之鸟，战意和士气非常低落，哪里能阻挡气势如虹的上杉军？
很快，藤堂虎高就冲破了六角军的阵势，随后又再度转身率骑马武士又杀入敌阵之中，一举将二百八十余六角军击溃。
而后，藤堂虎高并没有继续沿着石部原西面南下，反而是利用骑马武士的机动性，前往石部原中部的开阔地带后，再向南攻向石部城。
眼见藤堂虎高部没有按照自己预想的那样经石部原西面密林南下后，黑川与四郎、芥川七郎兵卫等人一面派遣一名忍者前往石部城告知主君六角承祯上杉军正大举南下的消息，一面率二十余名忍者紧随藤堂虎高部之后，意图伺机寻找合适之机，讨取上杉军的有名武士。
当黑川与四郎、芥川七郎兵卫等人好不容易迂回至藤堂虎高部的后方，却刚好遇上了渡过野洲川的吉田重高部。
吉田重高在出仕六角家之时，就看不上这些忍者使出见不得人的勾当。加上箕作城之战中，六角承祯、六角义治父子没有派出一兵一卒去驰援遭到以上杉军为首的官军围攻的箕作城，导致以吉田重政、吉田和泉守、吉田若狭守、松本民部少辅等吉田一族武士为首的守军一千余人被讨取。
故而，吉田重高可不打算放过面前不远处的这些六角军忍者，便毫不犹豫的下令麾下军势放箭。
要知道，吉田一族的日置流弓术是扬名于近畿诸国的。
在吉田重高的一声令下，吉田势的武士、足轻先单膝跪地，而后手扣弓弦箭羽，俯下身子，然后猛然立起，以精准的眼力与强劲的膂力后，将箭矢射出。
转瞬之间，黑川与四郎、芥川七郎兵卫等二十余人都没转身跑几步，便尽数被吉田重高麾下的持弓武士、持弓足轻射杀。
而藤堂虎高自知麾下兵力寡少，也不打算贸然对石部城发起攻击，便心生一计，分出一半的骑马武士，让他们将树枝拴在马尾上，并迂拖着树枝策马飞奔，弄得是尘土飞扬。
但石部城中的守军对此并不知晓实情，还以为是上杉军的大军已经兵临城下了。
加上黑川与四郎、芥川七郎兵卫等人先前派来的忍者也告知了菩提寺城、青木城、谷城三城在半天之内就被上杉军攻落的消息后，使得六角承祯、六角义治父子几乎被吓得魂飞魄散，哪里还有继续抵抗上杉军侵攻的底气？
随后，六角承祯、六角义治父子就命百地三太夫作为护卫，带着家眷再度逃离了石部城，让石部城城主石部家清负责继续坚守城池，以阻遏上杉军持续南下的步伐。
与此同时，宇佐美定满这一路军势在越过水口丘陵后，攻势也是异常顺利。
虽然，宇佐美定满配下没有熟悉甲贺郡地理的南近江诸将参阵，但依靠兵力、装备上的优势，还是接连攻落畑村城、山村田引城、迎山城、伴中山城、山村城、北脇城等十余座城池兵砦，还讨取了针和泉守、小川孙三郎、野田五郎等数名甲贺郡诸将。新城越前守、青木筑后守、大野宫内少辅等人见势不妙，更是不战而逃。
不过，作为六角家旗下有力国人领主，且实力丝毫不亚于甲贺众笔头家望月家的山中家，却并没有不战而逃，反而是做好充分笼城固守的准备。同时，山中俊好还派遣使者前往距离居城山中城仅有三里不到的大池寺城，请求同为甲贺柏木三家之一的美浓部家对自己伸出援手，遥相呼应，一同阻遏上杉军的攻势。
山中家的苗字来源于铃鹿山上山中村，在镰仓幕府统治时期的嘉禄二年（1226年），山中家家祖橘中务丞俊信在讨伐铃鹿山山贼之时立下功绩，被镰仓府授予山中村地头职、铃鹿山盗贼追捕使等职，此后就将苗字改为了山中。
而甲贺郡中的岩屋家、大平家、石部家、野村家、山村家、三云家、宇田家、原家等国人领主皆是山中家的庶子家。
虽说山中一族获得镰仓幕府的重用而发迹，可在元弘之乱爆发后，山中家却对镰仓幕府恩将仇报，不仅拒绝镰仓军通过铃鹿山一带，还主动倒向了朝廷一方，获得了后醍醐天皇授予的铃警固役之职。
没过多久，后醍醐天皇与足利尊氏之间交恶，山中家并没有继续站在朝廷一方，反而是倒向了足利尊氏一方，向支持朝廷的顿宫家、小佐治家等甲贺郡国人领主发起攻击。
而后，山中家虽然在关应扰乱爆发后，一度倒向南朝一方，但在北朝一方获得优势之际，又叛离了南朝，重返北朝一方。
在应仁之乱爆发后，山中家倒是支持西军一方的六角家，与东军一方的京极家展开交锋，并于文明二年（1470年）的蒲生郡黑桥之战中表现活跃。
等到了第一次六角征伐的长享元年（1487年）九月，山中家被时任六角家家督六角高赖要求固守栗太郡山田口一带。
只是，六角军兵力寡少，在野洲河原之战中被占有绝对兵力优势的足利军一举击溃，六角高赖被迫放弃本据观音寺城逃往甲贺郡之中藏匿。
在长享元年十二月，以山中橘六为首的甲贺众奉六角高赖之命，对足利军本阵所在的上钩寺发起了夜袭，对足利军造成了相当的损失。
此后，有着活跃功绩的五十三名甲贺众被六角高赖授予感状，还将其中的二十一人收为了直臣。
即便山中家获得了六角家的重用和信赖，但山中家依旧没有死心塌地的效忠于六角家，反而在六角家与浅井家交锋之际，被浅井长政调略，获得浅井家颁下野洲郡、栗太郡、志贺郡、桐原七乡等地的安堵状。
若非浅井家因支援北陆道一向一揆众与上杉家交恶，山中家也不会选择归参六角家保全本领和家名。
可美浓部家这边却没有与山中家并肩作战的想法。
别看美浓部家是甲贺郡的柏木三家之一，且实力丝毫不亚于同为柏木三家的山中家。
与山中家不同的是，美浓部家从未受到过朝廷、幕府的重视和重用。因美浓部乡曾经隶属于菅原家，此后美浓部家就尊菅原氏为自家祖先。
由于美浓部领与山中领接壤，自古以来两家多次争夺柏木神社周边肥沃土地、水源而发生大大小小的冲突。而且，山中家是甲贺五十三家之中最为反复无常的一家。
加上现任美浓部家家督美浓部上总介是迎娶了蒲生定秀之妹为正室，并在之前还将六角家意图派遣忍者行刺上杉家笔头重臣上杉定虎之事秘密告知。
若不是蒲生定秀、蒲生贤秀要求美浓部上总介继续蛰伏于六角家之中，他早就有意效仿多罗尾家那样倒向上杉家一方了。
就在宇佐美定满、水谷正村、长尾当长、一栗放牛等将上杉军诸将几乎横扫柏木庄、水口乡两地，进而攻向甲贺山中城之际，美浓部上总介赶紧将自己的儿子美浓部六郎三郎作为人质，送往观音寺城以示恭顺之意，并下令协防音羽野城、土山城、平子城等东甲贺郡城池兵砦的美浓部六右卫门尉、美浓部下总守等同族家臣、家中之人伺机刺杀守将、打开城门策应蒲生势的攻势，他自己还主动开城向上杉军投降。
获知美浓部家叛离六角家消息的山中俊好是愤怒不已，但也无济于事。他很早就意识到六角家是艘即将倾覆的破船，可一直以来没有合适的机会与上杉家进行联系，临近周边的国人领主们也没有人愿意为山中家牵线搭桥。这就使得山中家上下只能硬着头皮继续追随六角承祯、六角义治父子。
即便没有周边有力国人领主的支援，山中俊好也没有因此而感到气馁。
再怎么说，山中家是盘踞在甲贺柏木庄一带长达三百三十余年，不仅熟悉周边的地理，还有着民心的支持，完全能够击退来自上杉家的侵攻。
然而，山中俊好少算了一点——上杉军的装备。
上杉军可不是纯粹使用冷兵器，还装备着狭间铁炮、大铁炮、佛郎机炮等新锐火器，战法也与其他大名不同，极少发生使用蚁附攻城的状况。
此次负责攻打山中城的宇佐美定满部还被上杉清定配置了五门佛郎机炮。
山中城并非单一的城池，在山中家历代家督的加固、扩建下，以居城山中城为中心，北面有植城、唯称寺砦，西面有西出馆，西南方有极乐寺砦，东面有宇田砦。
在上杉军兵临城下之前，山中俊好就已经命治下领民前往山中城中进行协防，并将分别流经城北、城南的泉川、野洲川上的桥梁全部毁坏，打算以泉川、野洲川来作为山中城天然的护城河，还在泉川、野洲川两岸皆布置了大量逆茂木、乱杭、撒菱、栅栏等大量阻遏行军以及攻城之物来阻遏上杉军的攻势。
可出乎所有山中城守军意料之外的是，他们先前辛辛苦苦布置的一切，并没有起到什么作用。
宇佐美定满是巴不得甲贺众都一个个的固守在自己的居城之中，好让自己来个一勺烩。他最头疼的就是甲贺众潜伏于深山密林之中，这样会给上杉军造成极大的麻烦。
很快，在宇佐美定满的指挥下，上杉军先是将五门佛郎机炮架设在泉川的北岸一处高地上，在万事俱备后，就朝着山中城北面的植城、唯称寺砦展开猛烈的炮击。
随着五门佛郎机炮接连发出巨大的轰鸣声，大量炮弹发出的呼啸声锐利且刺耳，炮声更是震动人心。