正所谓天下熙熙，皆为利来；天下攘攘，皆为利往。
别看现任大乘院门迹大乘院寻宪是二条尹房（九条尚经女婿）之子、二条晴良之弟，但他却并没有与其兄二条晴良那样选择支持伪朝。
因为，大乘院寻宪不单单是因为二条晴良默许九条尚经之子寻円也在兴福寺大乘院出家为僧，还将兴福寺别当职授予松林院光实（日野内光之子、广桥守光养子），而兴福寺权别当之职则是授予东北院兼深（广桥兼秀之子）。
加上足利义晴早在天文九年（1540年），就将次男足利千岁丸送入兴福寺一乘院出家为僧，取法名觉庆，以加强足利将军家与兴福寺之间的羁绊。
兴福寺别当职素来是由一乘院、大乘院两院门迹来出任，即便松林院光实一度出任兴福寺别当，大乘院寻宪也没有直接表态反对，他还想着下一任的兴福寺别当将会由自己来出任。
可没曾想，在禁里之变发生后，以二条晴良为首的伪朝公们却将兴福寺别当职授予足利义辉之弟一乘门迹一乘院觉庆。这就让大乘院寻宪感到极为不满。
故而，在以上杉家为首的东国武家发起上洛之役后，大乘院寻宪直接选择了作壁上观，坐视三好家被上杉家的重创，而不对伪朝方面输送一兵一卒以及任何的粮草辎重。
因此，大乘院寻宪也在战后得以免于清算，并获得寺领安堵，以及大乘院门迹如故的待遇。
等一乘院觉庆急逝，不仅兴福寺别当职出现了空缺，就连一乘院门迹也出现了空缺。
大乘院寻宪早就有出任兴福寺别当的想法，便频繁向上杉家寺社奉行石川重久、寺社奉行代五味高重等人表示，自己愿意为上杉家献出五千贯永乐钱、两千两白银、五百两黄金、两万石粮食。
起初，面对大乘院寻宪的频繁示好，上杉清定并没有理会，只是让石川重久、五味高重等家臣告知大乘院寻宪，让其将这些钱粮用于修缮寺院、整备道路。
毕竟，清定是有意将兴福寺别当之职交给家中一门亲族众来出任，而不是出自伪朝逆臣二条家的大乘院寻宪。
可是，还没等上杉家高层决定由何人来出任一乘院门迹，近畿诸国就爆发了国人一揆。
所以，早就觊觎兴福寺别当职，以及兼并一乘院门迹领的大乘院寻宪在协助上杉家弹压松永家的反叛过程中，那是一个不遗余力。
大乘院寻宪不仅将死对头大乘院寻円赶走，还为北大和诸郡的上杉军提供粮草辎重补给，并派出了兴福寺僧侣中最擅长枪术，且作为兴福寺武力担当的宝藏院胤荣（中御门胤永次男，宝藏院流枪术之祖）来统辖僧兵，与穴泽氏清、柳生宗严等将一同行动。
而另一方面，松永久秀的撤兵顿时让河内一国的形势呈现出一边倒的局面。
自从和泉、纪伊两国再度被上杉家静谧，以及游佐信教、绫井仁世、安宅神五郎、玉井三河守、六人部加贺守等人先后被上杉军讨取的消息传入河内一国后，三箇赖照、田原对马守等人就指望着松永久秀能够尽快攻入河内境内，并压制河内一国。
当松永家使者坂合部延宗进入三箇城，并将松永军撤回大和的消息告知三箇赖照后，三箇赖照顿时面如土色。
虽说三箇家正与松永家、河内田原家等己方势力是遥相呼应，但所领可没有与松永领、河内田原领连成一片，更没有在北河内取得战略优势。
加上上杉家打压天主教的政策，以及三箇家庶子家三箇治部少辅家出身的三箇赖盛正出仕金吾畠山家，使得不愿改宗的三箇赖照根本没有其他的选项，只能硬着头皮选择继续与上杉家抗争下去。
然而，此时的三箇家中并不是所有人都愿意继续追随三箇赖照与上杉家抗争。
三箇赖世（三箇赖照之弟）、野原弥五郎等三箇家重臣们深知三箇家实力有限，眼下上杉家没有及时发兵前来讨伐只是三箇家运气好罢了，等到上杉家将摄津、和泉、纪伊、大和、播磨等近畿诸国的国人一揆都弹压了，届时三箇家必然将会面对上万规模的上杉军讨伐。
为了避免自己落得个身首异处的悲惨结局，三箇赖世、野原弥五郎等人自然是不愿跟着三箇赖照继续一条路走到黑的。
于是，三箇赖世、野原弥五郎等人在若江城城主畠山在氏、大宝寺城城主三好笑岩、饭盛山城城主大馆晴光、本丸山城城主鸟养宗庆、丹下城城主丹下盛知、丹南城城主平芳知（平盛长、平知茂）等上杉家河内诸将兵临城下之际，主动打开三箇城的大手门、追手门，并迎接上杉军入城。
也不等三箇赖照考虑好该如何抵御上杉军的侵攻，上杉军攻入城中的消息就传至本丸大广间。
在仓促之下，三箇赖照就命儿子三箇赖雄、三箇赖远赶紧率马廻众前去二之丸，想方设法夺回大手门、追手门的控制权。
然而，上杉军如同黑色潮水一般涌入城中，瞬间淹没了前来阻挡的三箇军，三箇赖雄、三箇赖远也先后在混战之中被上杉军讨取。
眼见二之丸失守后，三箇赖照、三箇赖连父子便意识到三箇城陷落也只是时间问题，再也无法依靠人力来扭转了。
最后，在万般无奈之下，三箇赖照、三箇赖连父子为了不在三箇城陷落后被俘，也不愿违背天主教教义而自尽，便选择在大广间之中互刺而亡。
至于三箇家的女眷则是尽数被俘，由大馆晴光率本部军势押往京都所司代地牢之中，等待上杉定虎的发落。
而田原城城主田原对马守在获知三箇城被上杉军围攻后，一开始是准备出兵驰援的，但在行至龙间谷之际，遭到了大馆晴光部的伏击。
因不知龙间谷一带上杉军的虚实，田原对马守也不敢恋战，更不敢贸然突破前去三箇城，便丢下五十余具尸体后，狼狈退回了居城。