尽管大村纯忠击退了后藤贵明、松浦隆信、西乡纯尧、深堀纯贤等人的侵攻，但西肥前诸郡的形势却并没有因此而有利于肥前有马家、大友家。
因大友家在今山之战中的惨败，导致肥前、筑前、丰前两国的国人领主们出现了动摇。
首先，之前慑于大友家兵威的筑紫家、高桥家、原田家、秋月家、宗像家等国人领主们在大友军兵败撤出肥前后，再度向大友家举起了反旗，导致短时间内，大友家无力组织起上万规模的大军再度对龙造寺家进行讨伐；
其次，今山之战前，因无法获得龙造寺家支援而被迫降服于大友家军门之下的江上家，在大友军撤出肥前后，重新归参龙造寺家，江上武种还收龙造寺隆信的三男龙造寺又四郎为养子，让其继承了江上家家名，并出任东肥前重镇要地势福寺城城主；
再次，被龙造寺隆信称之为肥前最大难敌的神代胜利自知时日无多，他在获知今山之战的结果后，便将家督之位传给了自己的嫡男神代长良，并让其与龙造寺家进行停战议和，之后让自己年仅四岁的孙女与龙造寺隆信的三男鹤仁王丸缔结婚约，正式与龙造寺家握手言和，从此成为龙造寺家的旗下国人领主之一；
然后，先前加势肥前有马军的鹤田家、波多家、有田家等临近龙造寺领的国人领主们生怕遭到龙造寺家的报复，纷纷选择了主动降服于龙造寺家的军门之下；
而后，少贰政兴在今山之战后失去了神代家的有力策应，以及大友家、肥前国人领主联军的支持，导致其在三根郡境内陷入孤立无援的窘境，自知复兴少贰家家名无望的他选择了出家为僧；
最后，因肥前后藤家、西乡家、深堀家等有力旗下国人领主先后叛离，以及原先的友军平户松浦家反目成仇后，肥前有马家的势力范围急剧缩水，大量家臣因其许可天主教传教的缘故也开始对肥前有马家阳奉阴违，导致有马义贞的政令都不出高来郡。
就在龙造寺隆信在今山之战成功击退了大友军的侵攻，并在肥前、筑前、筑后等国大肆扩大影响力之际，上杉清定可没有忘记躲在南近江甲贺郡深山老林里苟延残喘的六角承祯、六角义治父子，更没有忘记与六角家互为掎角之势的仁木义视。
在清定看来，六角家、仁木家两家就算于长光寺城之战中遭到了官军重创，但仍然在甲贺郡、伊贺国两地之中拥有不少支持者。
为了避免上杉军本队前脚离开近江，后脚六角承祯、仁木义视二人再度举兵北上反攻，清定就打算在班师返回东国之前，震慑一下六角家、仁木家，以及近江一国的新附国人领主们。
很快，清定就将目光投向了位于甲贺郡与野洲郡境目地带的石部城。
起初，六角承祯、六角义治父子在长光寺之战惨败后，就在石部城短暂停留后，就逃往临近甲贺郡境目地带的北伊贺阿拝郡福地城，受到福地伊予守的庇护。
等到上杉清定节制官军主力光复京都，并接连压制了摄津、河内、和泉、播磨等近畿诸国后，六角承祯、六角义治父子这才松一口气，并悄悄潜回石部城，一面慰劳百地三太夫、建部秀清、建部秀信等石部城守将，一面继续打探上杉军本队的动向，生怕上杉军调转矛头再度指向尚未恢复元气的六角家。
即便六角承祯、六角义治父子没有对倒向上杉家一方的家中重臣、旗下国人领主们进行调略寝反，但六角家的存在对于上杉家来说始终是一个不稳定因素。
虽说上杉家在伊贺阿拝郡有藤林家、近江甲贺郡有多罗尾家的效忠，但终究只能牵制六角家、仁木家的一定战力，并不能将他们完全拖住。
而且，以服部民部少辅为首的部分不愿臣从上杉家的伊势北畠家家臣在伊势静谧后，选择逃入伊贺境内，获得了仁木家的庇护。
于是，清定就以侧室京极龙子即将临产为由，就命上杉军本队于蒲生郡、野洲郡进行休整，以此来迷惑六角承祯、仁木义视。
此时的上杉军本队去去除配置在各个重镇要地的守军后，仍有六万余军势、一万余阵夫，以及一门重型佛郎机炮、二十门轻型佛郎机炮。
正当清定准备下令朝着石部城发起大规模攻势之际，尼子家覆灭，以及现任毛利家家督毛利隆元中毒身亡的消息率先传入了近畿诸国。
虽然毛利隆元是被藤林正保毒杀，但终究不是在战场上将其讨取，属于不光彩行为，清定也就没有当众对藤林正保的功绩进行表彰，更没有下发感状，只是将一把品相较好的海部刀，以及一百两黄金作为赏赐。
而后，清定就命藤林正保重返伊贺，严密监视仁木家的一举一动。
对于旗下大名尼子家的覆灭，清定是完全没有料到的。
再怎么说，有驻扎在于山诸岛的原大内家水军众牵制，毛利家无法彻底封锁尼子领的沿海地区，上杉家也不断经海路为其输送粮草辎重，怎么就不能坚持到上杉家在近畿诸国站稳脚跟？
不过，值得庆幸的是，原尼子家旗下国人领主隐岐为清并没有倒向毛利家一方，反而是在月山富田城开城后，派遣使者前往于山国国府所在的郁陵岛，请求弘中方明、小原隆言、冷泉元丰等于山诸将支援。
这就使得反上杉家一方势力无法在攻灭尼子家后，切断上杉家与朝鲜、女真诸部的海上贸易。
而另一边，才重返石部城没多久的六角承祯在获知上杉清定因侧室京极龙子临产在即而选择逗留于南近江诸郡后，顿时有一种不祥的预感。
就算六角承祯的智略、军略、器量等各个方面远不及其父六角定赖，但他的智力水平还是和寻常之人相差不大，他总感觉上杉清定极有可能是打着侧室临产的名义，准备对六角家或是仁木家发起突袭，意图一举将近畿诸国彻底压制。